Département des Agents Infectieux

Ces 4 laboratoires partagent un secteur diagnostique commun intitulé « Métagénomique ».

Nos laboratoires sont situés au 2ème étage du bâtiment de Biologie de la Cavale Blanche, au CHU de Brest. Nous jouons un rôle clé dans le diagnostic et le suivi des infections, qu'elles soient bactériennes, virales, parasitaires ou fongiques.

Nos missions couvrent non seulement les services de soins du CHU de Brest, mais aussi ceux du CH de Landerneau. Le Département des Agents Infectieux réalise également des analyses spécialisées pour divers établissements de santé de notre territoire, tels que ceux de Saint-Renan, Morlaix, la Fondation Ildys (Ty Yann à Brest et Perharidy à Roscoff), ainsi que l'Hôpital d’Instruction des Armées de Clermont-Tonnerre.

Grâce à une équipe pluridisciplinaire dédiée, composée de biologistes médicaux (hospitaliers et hospitalo-universitaires), de technicien(ne)s de laboratoire, de cadres et de secrétaires, nous assurons une activité annuelle de plusieurs centaines de milliers d'analyses. La liste des analyses proposées est directement consultable sur notre catalogue en ligne, disponible sur le site du CHU de Brest.

Nos laboratoires sont engagés dans plusieurs missions essentielles, visant à améliorer la prise en charge des patients et à prévenir les risques infectieux :

• Activité d'urgence 24h/24 : Une équipe disponible en permanence pour répondre aux situations critiques.
• Surveillance des bactéries multi-résistantes : Nous suivons de près ces bactéries et émettons des alertes auprès du Comité de Pilotage du Risque Infectieux (COPRI) du CHU.
• Contrôle du risque infectieux : En collaboration avec le Service d’Épidémiologie et de Prévention du Risque Infectieux (SEPRI), nous identifions les micro-organismes responsables des infections nosocomiales.
• Diagnostic anténatal infectieux : Nous travaillons avec le réseau périnatalité pour détecter et traiter les infections pendant la grossesse.
• Qualification des dons d’organes : En lien avec la Coordination Hospitalière des Prélèvements d'Organes et de Tissus, nous vérifions la sécurité des organes donnés.
• Expertise en microbiologie clinique : Nous fournissons des conseils spécialisés aux hôpitaux de la région et travaillons avec les centres nationaux de référence et l’institut médico-légal.
• Formation et enseignement : Nous formons les futurs professionnels de santé, qu’il s’agisse d'internes (de biologie médicale, de maladies infectieuses et tropicales notamment), d’étudiants en médecine ou en sciences, ainsi que de stagiaires en BTS, licence et master.
• Déclaration des maladies infectieuses : Nous assurons la déclaration des infections à surveiller, telles que la tuberculose, la Covid-19, et autres maladies émergentes (Monkeypox, par exemple), auprès de l’Agence Régionale de Santé (ARS Bretagne).
• Évaluation et innovation : Nous participons à l’évaluation médico-économique et au développement de nouvelles techniques diagnostiques.
• Recherche et développement : Nous sommes impliqués dans des projets de recherche pour améliorer le diagnostic et le contrôle des infections, en collaboration avec des équipes de recherche labellisées (Inserm) et les Centres d’Investigation Clinique et de Ressources Biologiques (CIC/CRB).

Nos laboratoires sont organisés selon des normes de sécurité biologique strictes, afin d’assurer la protection des équipes et la fiabilité des analyses. Les secteurs analytiques fonctionnent tous selon un niveau de sécurité biologique de type 2, adapté à la manipulation d’agents infectieux courants. Un secteur supplémentaire est équipé selon un niveau de sécurité biologique de type 3, permettant la manipulation d'agents infectieux plus dangereux, de classe 3 (ex. agent de la tuberculose).

Ces laboratoires sont dotés d'équipements spécialisés adaptés à ces niveaux de sécurité, ainsi que d’outils dédiés au diagnostic des agents infectieux (culture microbiologique, diagnostic moléculaire, sérologie, microscopie). La plupart des gros équipements sont mutualisés, ce qui permet d’optimiser leur utilisation. Le service dispose ainsi d’équipements de pointe, tels que des extracteurs d’ADN/ARN, des thermocycleurs, un séquenceur haut débit, un spectromètre de masse, ainsi que des automates de sérologie et d’hémocultures.