Laboratoire de Bactériologie
Informations pratiques
Laboratoire de Bactériologie
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Contacts
Equipe medicale
Pr Geneviève HÉRY-ARNAUD (Professeur des Universités – Praticien Hospitalier)
Responsable médicale
genevieve.hery-arnaud@chu-brest.fr
Dr Hervé LE BARS (Praticien Hospitalier)
herve.lebars@chu-brest.fr
Dr Clémence BEAURUELLE (Maître de Conférences des Universités – Praticien Hospitalier)
clemence.beauruelle@chu-brest.fr
Dr Claudie LAMOUREUX (Praticien Hospitalier)
claudie.lamoureux@chu-brest.fr
Dr Valérie NARBONNE (Praticien Hospitalier responsable de la Qualité)
valerie.narbonne@chu-brest.fr
Dr Victor SCAVAZZIN (Assistant Hospitalo-Universitaire)
victor.scavazzin@chu-brest.fr
Organisation
Le laboratoire de Bactériologie comporte 4 secteurs :
- Bactériologie conventionnelle (examen direct à partir des frottis, cytologie, culture bactérienne, réalisation des antibiogrammes, étude des CMI)
- Bactériologie moléculaire de routine (plateformes automatisées extraction-amplification pour les panels syndromiques, qPCR, séquençage Sanger)
- Mycobactériologie (laboratoire NSB3 et tests IGRA)
- Métagénomique clinique (séquençage haut débit)

MISSIONS
Le laboratoire de Bactériologie participe à la triple mission de soins, recherche et enseignement du CHU de Brest. Seul laboratoire hospitalo-universitaire de Bactériologie sur la région Bretagne Occidentale, il intervient sur tout le territoire de santé en partenariat avec les établissements publics et privés du territoire.
Le laboratoire de Bactériologie est accrédité par le COFRAC selon la norme ISO 15189, garantissant ainsi la qualité et la fiabilité de nos analyses. Nous sommes spécialisés dans plusieurs domaines essentiels pour la santé :
- Diagnostic et suivi des infections bactériennes : Nous analysons tous types de prélèvements biologiques pour identifier et suivre les infections bactériennes. Nous assurons une permanence 24H/24 pour le diagnostic des infections à caractère vital (les méningites bactériennes par exemple).
- Étude des résistances bactériennes aux antibiotiques. Nous surveillons les résistances des bactéries aux traitements, un enjeu crucial pour la lutte contre les infections.
- Conseil auprès des cliniciens et équipes médicales. Nous apportons notre expertise en bactériologie clinique pour soutenir les décisions médicales et améliorer la prise en charge des patients.
- Surveillance et Alerte Sanitaire. L'alerte sur l’émergence de nouveaux pathogènes et des résistances aux antibiotiques est un enjeu majeur pour la santé publique. Dans le cadre de cette mission, le laboratoire de Bactériologie joue un rôle crucial dans :
- Le dépistage des bactéries multirésistantes (BMR) et des bactéries à haut risque épidémique (BHRe).
- La transmission des souches aux Centres Nationaux de Référence (CNR) pour contribuer à la surveillance épidémiologique nationale.
- La déclaration des maladies à déclaration obligatoire, en étroites relations avec l’Agence Régionale de Santé, Santé Publique France et les CNR, afin de garantir une réponse rapide aux menaces sanitaires.
• Secteurs d'Excellence et Veille Technologique. Nous investissons également dans des secteurs d'excellence, où nous mettons en œuvre des outils de pointe pour améliorer le diagnostic et le traitement des infections complexes. Ces secteurs sont :
o Antibiologie : Expertise sur l'étude des résistances aux antibiotiques et des mécanismes sous-jacents en collaboration avec le Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, par exemple dans le cadre du Centre de référence des infections ostéo-articulaires complexes du Grand Ouest (CRIOGO).
o Mucoviscidose et maladies respiratoires chroniques : En collaboration avec le CRCM de Roscoff et le Service de Pneumologie du CHU de Brest et du CH de Landerneau.
o Tuberculose et autres mycobactérioses : en lien avec le Centre de Lutte Antituberculeuse (CLAT) du CHU de Brest
o Métagénomique clinique pour le diagnostic des infections complexes : en lien avec le Centre Brestois d’Analyse du Microbiote (CBAM)
o Transplantation de microbiote fécal : en lien avec le Groupe Brestois de Transplantation Fécale.

Offres de service
Le laboratoire de Bactériologie offre un large panel diagnostique direct et indirect. Le détail des analyses est consultable sur le catalogue des examens de laboratoire. Le laboratoire de Bactériologie du CHU Brest est reconnu comme laboratoire de Biologie médicale de Référence (LBMR) dans quatre domaines d’expertise (JORF n°0146 du 22 juin 2024) : •
- Aide à la prise en charge des infections ostéo-articulaires complexes
- Diagnostic biologique des mycobactérioses
- Suivi bactériologique des patients atteints de mucoviscidose ou d'autres pathologies respiratoires chroniques
- Diagnostic microbiologique par métagénomique shotgun.
Recherche et enseignement
Recherche
Le laboratoire de Bactériologie est rattaché, pour sa recherche académique, à l’axe de recherche Microbiota (Resp. Pr G. Héry-Arnaud) de l’unité INSERM UMR 1078 « Génétique, Génomique fonctionnelles et Biotechnologies » (Directrice d’Unité : Dr E. Genin,). L’équipe explore en particulier les infections broncho-pulmonaires à travers l’analyse approfondie du microbiote des patients.

Les biologistes participent également à l’axe « Médecine génomique » du CHU de Brest (Resp. Prs Cédric Le Maréchal et G. Héry-Arnaud) ainsi qu’à la recherche clinique au CHU de Brest, en particulier comme laboratoire coordonnateur de 2 programmes hospitaliers de recherche clinique :
Enseignement
Les biologistes du laboratoire assurent l’enseignement de la bactériologie fondamentale et appliquée auprès des internes de Biologie Médicale et des étudiants de Médecine, de Maïeutique, d’Odontologie, de Sciences, du l’IUT de Brest (Génie biologique), et de l’IFSI :
- UE Agents infectieux et Hygiène (UBO)
- UE Microbiote et biodiversité en Santé Humaine du Master 1 BioSanté
- UE “human Microbiome in Health & Diseases” Master 2 de Microbiologie Fondamentale et appliquée (Brest et Rennes)
- UE « Microbiote et Implication en Santé » du Master2 Infectiologie et physiopathologie des cancers thérapeutiques (Amiens)
- DU Thérapeutiques anti-infectieuses (Brest, Angers)
- DU « les Agents Infectieux à l’Ère de la Génomique » (Nantes)
- UE Revêtement cutané (UBO)
- UE Plaies et Cicatrisation (UBO)
Le laboratoire de Bactériologie accueille des étudiants en stage (internes de Biologie médicale, Internes de Maladies Infectieuses et Tropicales et externes de Médecine IUT ABB, BTS, M1, M2).
