Laboratoire de virologie

Equipe médicale :

Dr Adissa MINOUI-TRAN (Praticien Hospitalier) - Responsable médicale -  Adissa.tran-minoui@chu-brest.fr

Pr Christopher PAYAN (Professeur des Universités – Praticien Hospitalier) - Christopher.payan@chu-brest.fr

Dr Sophie VALLET (Maître de Conférences des Universités – Praticien Hospitalier) -  Sophie.vallet@chu-brest.fr

Dr Léa PILORGE (Praticien Hospitalier) - lea.pilorge@chu-brest.fr

Dr Romain LEGROS (Assistant Hospitalo-universitaire) Romain.legros@chu-brest.fr

Missions

Le laboratoire de Virologie du CHU de Brest assure des missions de diagnostic, de Recherche, d’enseignement et de formation.

Seul laboratoire de Virologie sur la région Bretagne Occidentale, il intervient sur tout le territoire de santé en partenariat avec les établissements publics et privés du territoire.

Il joue un rôle majeur dans le diagnostic et le suivi pronostic et thérapeutique des infections virales, en proposant des solutions adaptées et performantes.

Fortement impliqué dans la surveillance épidémiologique des infections virales, le Laboratoire de Virologie assure d’étroites relations avec l’Agence Régionale de Santé, la Santé Publique France, ainsi qu’avec les Centres Nationaux de Référence (CNR). Dans le cadre de ses missions de veille sanitaire, il est amené à développer et à mettre en œuvre des outils diagnostiques et de surveillance des infections liées aux virus saisonniers et/ou émergents.

Le Laboratoire de Virologie interagit étroitement avec des structures de prévention et de dépistage telles que le Centre de dépistage anonyme et gratuit (CeGIDD), le Centre de Santé Sexuelle (CSS), la Coordination régionale des centres de dépistage des cancers de Bretagne (CRCDC). Il est également membre actif du réseau périnatalité Bretagne occidentale et du Centre pluridisciplinaire du diagnostic périnatal du CHU Brest.

Assurant une permanence 24H/24, il intervient dans la qualification virologique des donneurs d’organes et de tissu, ainsi que dans l’évaluation du risque de transmission virale dans le cadre des accidents d’exposition.

Le laboratoire de Virologie apporte également son expertise dans le traitement des dossiers médico-légaux et médico-judiciaires.

Offre de service

Le laboratoire de Virologie offre un large panel diagnostic direct et indirect.

• Rétrovirus (VIH1-2, HTLV1-2);  Virus des hépatites A, B, C, E;
• Herpès virus (HSV, VZV, EBV, CMV, HHV6, HHV8);
• Fièvres éruptives (Rougeole, Rubéole, Parvovirus B19)
• Papillomavirus humains (HPV) et Polyomavirus (BK virus, JC virus);
• Virus responsables de gastroentérites;
• Virus responsables d'infections respiratoires;
• Virus responsables de méningites et de méningo-encéphalites
• SARS-CoV-2 et ses variants
• Arbovirus (virus de la Dengue, CHIK, Zika virus, Virus du Nile Occidental)
•  

Le détail des examens est consultable sur le catalogue des actes du laboratoire.

Le diagnostic virologique indirect (sérologie) est assuré par une plateforme entièrement automatisée, fonctionnant 5 jours sur 7.

Le diagnostic virologique direct est réparti sur trois secteurs distincts :

• Plateforme à réponse rapide permettant de répondre au diagnostic d’urgence
• Plateforme moléculaire ouverte et mutualisée
• Plateforme de séquençage (Sanger et NGS)

Une solution délocalisée est également déployée dans les services d’Urgences permettant le diagnostic « Point Of Care (POC) » de SARS-CoV-2, des virus grippaux et du VRS.

Laboratoire de biologie médicale de référence (LBMR)

Le laboratoire de Virologie du CHU Brest est reconnu comme laboratoire de Biologie médicale de Référence (LBMR) dans deux domaines d’expertise :

• Diagnostic prénatal des infections virales à transmission materno-foetale
• Suivi virologique des patients transplantés d’organes solides et/ou des receveurs d’allogreffes de moelle osseuse
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Enseignement et recherche 

Enseignement 

Les biologistes du laboratoire assurent l’enseignement de la virologie fondamentale et systématique auprès des étudiants de Médecine, de Maïeutique, d’Odontologie et de Sciences :

• UE Agents infectieux et Hygiène
• UE Microbiologie
• UE Microbiote et biodiversité en Santé Humaine du Master BioSanté
• UE Virosphère du Master de Microbiologie Fondamentale et appliquée UR1-UBO
• UE Réactions de défense
• DU d’Hygiène de l’UFR Médecine

Le laboratoire de Virologie accueille des étudiants en stage (IUT ABB, M1, M2, Internes de Biologie médicale, Internes de Médecine et Etudiants de Médecine).

Recherche 

Le laboratoire de Virologie est rattaché, pour sa recherche académique, à l’unité Microbiota de l’UMR 1078 « Génétique, Génomique fonctionnelles et Biotechnologies » (Dr E. Genin, Université Bretagne Occidentale, UBO).

Le laboratoire de Virologie est impliqué dans l’étude des interactions des micro-organismes dont les virus, dans les infections respiratoires (Microbiote et Virome) ;

Il développe des méthodes d’exploration basées sur l’analyse des génomes (NGS) et la PCR digitale (Collaboration CNR Lyon) ;

Il participe également à la recherche clinique au CHU de Brest dans divers domaines :

• Nouveaux marqueurs de suivi des patients transplantés d’organes solides (Collaboration CHU Limoges)
• PHRCI CYTOPREV (CHU Rouen) : Efficacité d’une stratégie préventive de l’infection à cytomégalovirus immuno-guidée comparativement à une stratégie prophylactique universelle chez le transplanté rénal  Nouveaux marqueurs de dépistage du cancer du col de l’utérus (Collaboration avec le CRCDC Bretagne, l’Institut National du Cancer et la Ligue Contre le Cancer), avec l’évaluation de l’intérêt d’un test HPV urinaire à domicile pour favoriser le dépistage dans le cadre d’un projet PREPS du Ministère de la Santé

Le laboratoire de Virologie participe activement aux études multicentriques de l’AC43 de l’ANRS MIE.