Laboratoire de virologie (UF 8873)
Equipe médicale :
Dr Adissa MINOUI-TRAN (Praticien Hospitalier) - Responsable médicale - Adissa.tran-minoui@chu-brest.fr
Pr Christopher PAYAN (Professeur des Universités – Praticien Hospitalier) - Christopher.payan@chu-brest.fr
Dr Sophie VALLET (Maître de Conférences des Universités – Praticien Hospitalier) - Sophie.vallet@chu-brest.fr
Dr Léa PILORGE (Praticien Hospitalier) - lea.pilorge@chu-brest.fr
Mission
Le laboratoire de Virologie du CHU de Brest assure des missions de diagnostic, de Recherche, d’enseignement et de formation.
Seul laboratoire de Virologie sur la région Bretagne Occidentale, il intervient sur tout le territoire de santé, en intra-hospitalier, ainsi qu’en partenariat avec les établissements publiques et privés du territoire.
Il joue un rôle majeur dans le diagnostic et le suivi pronostic et thérapeutique des infections virales, en proposant des solutions adaptées et performantes.
Fortement impliqué dans la surveillance épidémiologique des infections virales, le Laboratoire de Virologie entretient d’étroites relations avec l’Agence Régionale de Santé, la Santé Publique France, ainsi qu’avec les Centres Nationaux de Référence (CNR). Dans le cadre de ses missions de veille sanitaire, il est amené à développer et à mettre en œuvre des outils diagnostiques et de surveillance des infections liées aux virus saisonniers et/ou émergents.
Le Laboratoire de Virologie collabore activement avec des structures de prévention et de dépistage telles que le Centre de dépistage anonyme et gratuit (CeGIDD), le Centre de Planification et d’Education Familiale (CPEF), la Coordination régionale des centres de dépistage des cancers de Bretagne (CRCDC). Il est également membre du réseau périnatalité Bretagne occident et du Centre pluridisciplinaire du diagnostic périnatal du CHU Brest.
Assurant une permanence 24H/24, il intervient dans la qualification virologique des donneurs d’organes et de tissu et dans l’évaluation du risque de transmission virale dans le cadre des accidents d’exposition.
Le laboratoire de Virologie apporte également son expertise dans le traitement des dossiers médico-légaux et médico-judiciaires.
La totalité des activités diagnostiques du laboratoire de Virologie est couverte par l’accréditation COFRAC selon la norme ISO 15189.
Equipements
Le laboratoire de Virologie offre un large panel diagnostique direct et indirect :
- Rétrovirus (VIH, HTLV)
- Virus des hépatites A, B, C, E
- Herpès virus (HSV, VZV, EBV, CMV, HHV6, HHV8)
- Rougeole, Rubéole
- Parvovirus B19
- Papillomavirus humains (HPV)
- Polyomavirus (BK virus, JC virus)
- Virus responsables de gastroentérite
- Virus responsables d’infection respiratoire
- Virus responsables de méningite et encéphalites (Enterovirus, Parechovirus, HSV,...)
- MERS-CoV, SARS-CoV-2 et ses variants
- Zika virus
Le diagnostic sérologique fonctionnant au fil de l’eau, 5 jours/7.
Le laboratoire est également composé d'un secteur spécifique dédié au diagnostic virologique direct disposant de tests antigéniques et moléculaires rapides permettant de répondre au diagnostic d’urgence (analyse en 10 à 70 mn selon les tests) et d'une plateforme de Biologie moléculaire mutualisée et ouverte permettant l’introduction de nouvelles méthodes de PCR (MERS-CoV, Covid19, et de Séquençage)
Laboratoire de biologie médicale de référence (LBMR)
Le laboratoire de Virologie du CHU Brest est désigné comme laboratoire de Biologie médicale de Référence (LBMR) dans deux domaines d’activité :
- Diagnostic prénatal des infections virales à transmission materno-foetale.
- Suivi virologique des patients transplantés d’organes solides et/ou des receveurs d’allogreffes de moelle osseuse.*
Enseignement et recherche
Enseignement
Les biologistes du laboratoire assurent l’enseignement de la Virologie auprès des étudiants de Médecine, de Maïeutique, d’Odontologie et de Sciences :
- UE Agents infectieux et Hygiène
- UE Microbiologie
- UE Microbiote et Biodiversité en santé humaine du Master BioSanté
- UE Virosphère du Master de Microbiologie Fondamentale et Appliquée UR1-UBO
- UE Réactions de Défenses
- DU d’Hygiène de l’UFR Médecine.
Le laboratoire de Virologie accueille des étudiants en stage (DUT ABB, M1, M2, internes de Biologie, Internes de Médecine et Etudiants de Médecine)
Recherche
Le laboratoire est rattaché pour sa recherche académique à l’Unité Microbiota de l’UMR 1078 « Génétique, Génomique fonctionnelles et Biotechnologies » (Dr E. Genin, Université Bretagne Occidentale, UBO).
Le laboratoire est impliqué dans l’étude des interactions des micro-organismes dont les virus dans les infections respiratoires (Microbiote et Virome) ; il développe des méthodes d’exploration basées sur l’analyse des génomes (NGS) et la PCR digitale (collaboration CNR Lyon).
Le laboratoire développe aussi une recherche clinique au CHU de Brest dans le domaine des nouveaux marqueurs pour :
- Suivi des patients transplantés (collaboration CNR CMV à Limoges et le laboratoire de Virologie de Strasbourg)
- Dépistage du Cancer du col de l’utérus (collaboration avec le CRCDC Bretagne, l’Institut National du Cancer et la Ligue contre le Cancer), avec l’évaluation de l’intérêt d’un test HPV urinaire à domicile pour favoriser le dépistage dans le cadre d’un projet PREPS du Ministère de la Santé.
Le laboratoire participe aux études multicentriques de l’AC43 de l’ANRS MIE.